Odsjek za povijest hrvatske glazbe osnovan je 1980. godine kao Zavod za muzikološka istraživanja Istraživačkog centra JAZU sa zadatkom da sustavno istražuje sve aspekte hrvatske glazbene kulture u međunarodnom kontekstu, u čemu je jedinstvena ustanova u Hrvatskoj. Od 1993. godine Zavod mijenja ime u Odsjek za povijest hrvatske glazbe Zavoda za povijest hrvatske književnosti, kazališta i glazbe Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti.
Od 1984. do 1991. godine projekt Zavoda pod nazivom „Fundamentalna istraživanja za povijest hrvatske glazbe“ organiziran je i provođen u osam zadataka: 1) Srednji vijek, 2), Renesansa, 3) Barok i klasika, 4) Devetnaesto stoljeće, 5) Dvadeseto stoljeće, 6) Glazbena dokumentacija, 7) Glagoljaško pjevanje i obredna narodna glazba, 8) Muzikologija i interdisciplinarnost. Tako su u Zavodu za muzikološka istraživanja artikulirani zadaci prema povijesnim razdobljima te sistematskim temama poput istraživanja glazbenih arhivalija i estetike glazbe. Ovaj opsežan, dugoročan i cjelovit projekt podijeljen je na manje cjeline te od 1991. godine znanstvenici i istraživači u Zavodu sudjeluju na zasebnim projektima u okviru njihove znanstvenoistraživačke djelatnosti.
Stalno zaposleni znanstvenici uglavnom rade na zasebnim istraživačkim projektima, od kojih se ističu nacionalni projekti: „Sređivanje, katalogiziranje i obradba muzikalija i drugih glazbenih izvora u Hrvatskoj“ (1991-2013; prof. dr. sc. suradnice Vjera Katalinić i Lucija Konfic; voditelj akademik Stanislav Tuksar – preko Muzičke akademije), „Spomenici hrvatske glazbene baštine (2007.-2013.), (voditelj: prof. dr. sc. Ennio Stipčević, suradnice: akademkinja Koraljka Kos, dr. sc. Hana Breko Kustura), „Tradicija glagoljaškog pjevanja“ (2002-2011; voditeljica dr. sc. Gorana Doliner) te „Hrvatska glazbena historiografija do 1945. godine“ (1996-2013; voditeljica dr. sc. Sanja Majer-Bobetko). Od 2003. znanstvenici iz Odsjeka sudjeluju i na međunarodnim projektima. Prof. dr. sc. Vjera Katalinić bila je suradnica na međunarodnim interdisciplinarnim projektima „Oper im Wandel der Gesellschaft“ (Volkswagen-Stiftung, 2005-2008) i “Europe and Beyond: Transfers, Networks and Markets for Musical Theatre in Modern Europe, 1740-1960” (European University Institute, 2009-2011) te je voditeljica europskog projekta “Music Migrations in the Early Modern Age: the Meeting of the European East, West and South” (HERA, 2013-2016). Prof. dr. sc. Ennio Stipčević bio je voditelj hrvatske sekcije na projektu „Aux confins de l’humanisme musical: monde slave et culture méditerranéenne“ (Centre d’Etudes Superieures de la Renaissance, 2010-2012).
Dosadašnji djelatnici (istraživači i znanstvenici, te stručni suradnici) u Odsjeku za povijest hrvatske glazbe
- Zdravko Blažeković (1.X.1980.-30.IX.1981; 1.VII.1984.-31.III.1991.)
- Martina Bratić, stručna suradnica bez zasnivanja radnog odnosa (20.VII.2015.-31.III.2016.)
- Hana Culjak, stručna suradnica za rad u knjižnici (9.III.2009.-20.VII.2009.)
- Ana Čizmić (2.VI.2009.-27.IV.2010.)
- Gorana Doliner (3.X.1983.- 31.XII.2011.)
- Dubravka Franković (1.X.1980.-28.VI.1995.)
- Katarina Livljanić (8.XII.1989.-31.XII.1997.)
- Sanja Majer-Bobetko (1.X.1993.-31.XII.2019.)
- Maja Milošević, znanstvena novakinja na projektu MusMig (1.II.2015.-31.VII. 2016.)
- Rozina Palić-Jelavić, znanstvena suradnica (XI.1998.-31.XII.2022.)
- Ladislav Račić (1.X.1980.-30.IX.1981.)
- Sara Ries, doktorandica na projektu NETMUS19 (1.VIII.2018. -30. IX.2021.)
- Marinela Rusković-Krištić, znanstvena novakinja (1.IV.2004.-31.III.2013.)
- Stanislav Tuksar (1.X.1980.-29.II.1992.)
- Zrinka Vitković, stručna suradnica za rad u knjižnici (1.V.2007.-1.II.2008.)
- Vilena Vrbanić, stručna suradnica bez zasnivanja radnog odnosa (21.XII.2012.-20.XII.2013.), suradnica na projektu MusMig (od 23.XII.2013.-31.VIII.2016.)
Dosadašnji voditelji u Odsjeku za povijest hrvatske glazbe
- Ivan Supičić: 1980.-1984.
- Ladislav Šaban: 1984.-1985.
- Koraljka Kos: 1985.-1992.
- Nikša Gligo: 1993.-1996.
- Koraljka Kos: 1996.-
Nazivi pod kojima je djelovao Odsjek za povijest hrvatske glazbe:
- Zavod za muzikološka istraživanja (od osnutka do 1992.)
- Zavod za povijest hrvatske glazbe (od 1.travnja 1992.-1993.)
- Odsjek za povijest hrvatske glazbe, u okviru Zavoda za povijest hrvatske književnosti, kazališta i glazbe (od 28. listopada 1993.- )
Lokacije na kojima je djelovao Odsjek:
- Matičina 2 (do lipnja 1990.)
- Opatička 10 (od lipnja 1990. do srpnja 1991.)
- Opatička 18 (od srpnja 1991. – )
Raniji projekti
- Fundamentalna istraživanja za povijest starije hrvatske glazbe (1981.-1983.); koordinator: Ivan Supičić
- Fundamentalna istraživanja za povijest hrvatske glazbe (1983.-1991.); koordinatori: Ladislav Šaban, Koraljka Kos
- Hrvatska glazbena kultura 1800-1918. (1991.-1995.); glavni istraživač: Dubravka Franković
- W. A. Mozart i hrvatska glazbena kultura 1750-1820 (1991.-1996.); glavni istraživač: Vjera Katalinić
- Hrvatsko-talijanski glazbeni kontakti u 16. i 17. st. (1991.-1995.); glavni istraživač: Ennio Stipčević
- Sređivanje i katalogizacija muzikalija u Hrvatskoj (1991.-1992.); glavni istraživač: Stanislav Tuksar (nakon 1992. do 2013. projekt je prijavljen preko Muzičke akademije, a na njemu i dalje sudjeluju znanstvenici i istraživači iz Odsjeka)
- Osam stoljeća hrvatske duhovne glazbe (1992.-2004.); glavni istraživač: Ennio Stipčević
- Hrvatska glazbena historiografija do 1945. godine (1996.-2013.); glavni istraživač: Sanja Majer-Bobetko
- Tradicija glagoljaškog pjevanja (2002.-2011.); glavni istraživač: Gorana Doliner
- Spomenici hrvatske glazbene baštine (2007.-2013.); glavni istraživač: Ennio Stipčević
- Music Migrations in the Early Modern Age: the Meeting of the European East, West and South”, MusMig (2013.-2016.); voditeljica Vjera Katalinić
- Umrežavanje glazbom: promjene paradigmi u „dugom 19. stoljeću“ – od Luke Sorkočevića do Franje Ks. Kuhača, NETMUS19 (2017.-2021.)
- Hrvatski glazbeni i liturgijski kodeksi srednjega vijeka: Interdiciplinarna obrada, IP 6619, CROMUSCODEX70 (2017.-2021.)